蓬江區地處北回歸線以南，屬南亞熱帶海洋性季風氣候。冬短夏長，氣候宜人，雨量充沛，光照充足。無霜期在360天以上，全年無雪。
春季，2月下旬至4月下旬。冷空氣活動減弱，南方暖濕氣流加強北推，氣溫明顯回升。降水增多，有暴雨、洪澇等氣象災害。初春時節弱冷空氣仍活躍，會出現低溫陰雨或倒春寒。
夏季，5月至10月下旬。盛行西南季風，是全年雨量、熱量、日照最充足的季節。強對流和雷電等較頻繁，也是颱風多發時段。盛夏期間，受副熱帶高壓控制，天氣炎熱。受颱風影響，往往帶來大量雨水。端午節前後，受西江上游影響，區內會出現洪水或造成洪澇，俗稱“龍舟水”。
秋季，10月末至次年1月中旬。受北方冷空氣南下影響，溫度逐漸下降，降雨減少，晴朗乾燥天氣多，日夜溫差較大。初秋強冷空氣會帶來寒露風天氣，偶有霜凍。
冬季，1月下旬至2月中旬。盛行東北季風，大寒前後為全年最冷時段，偶有霜凍。受南下冷空氣和潮濕氣流影響，常出現低溫陰雨天氣，影響早稻育種插秧。